Trên cương vị là Phó Chủ nhiệm Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy, được ủy quyền giải quyết công việc của đơn vị trong thời gian thủ trưởng cơ quan điều trị tại bệnh viện, trong quá trình xử lý công việc - ông Lê Hữu Thọ đã chủ quan, thiếu thận trọng, để lộ lọt một số thông tin nội bộ cơ quan cho người không có trách nhiệm biết, vi phạm Quy định số 04-QĐ/UBKTTU, ngày 5/2/2017 về công tác bảo vệ bí mật trong cơ quan Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy.
Trụ sở Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy nơi ông Thọ công tác Bên cạnh đó, ông Lê Hữu Thọ nhận quà và trả lại quà không đúng quy định, phương pháp của công tác kiểm tra vi phạm Quy định số 47-QĐ/TW, ngày 1/11/2011 của Ban Chấp hành Trung ương về những điều đảng viên không được làm.
Thông cáo báo chí kết quả Kỳ họp thứ 38 của Ủy ban Kiểm tra Tỉnh ủy Quảng Trị nêu rõ: “Vi phạm của đồng chí đã làm ảnh hưởng xấu đến uy tín của tập thể và cá nhân đồng chí."