Dự án Nha Trang Center 2 được xây dựng tại số 01 Trần Hưng Đạo, phường Lộc Thọ, TP Nha Trang, tỉnh Khánh Hòa. Đây là công trình đa năng cấp I thuộc nhóm A, được cấp Giấy chứng nhận đầu tư số 37121000619 lần đầu ngày 30/6/2015 bởi UBND tỉnh Khánh Hòa cho CTCP Thanh Yến thực hiện.
Theo Kết luận thanh tra, trong quá trình thẩm định thiết kế cơ sở dự án, Cục Quản lý hoạt động xây dựng (Bộ Xây dựng) không cung cấp được các tài liệu chứng minh đã nhận đủ thành phần hồ sơ theo quy định tại Biểu mẫu số 01, Phụ lục II của Nghị định số 59/2015/NĐ-CP ngày 18/6/2015.
Cụ thể, thiếu các tài liệu quan trọng như: quyết định lựa chọn phương án kiến trúc, quyết định lựa chọn nhà thầu lập dự án, văn bản thẩm duyệt hoặc ý kiến về báo cáo đánh giá tác động môi trường, hồ sơ khảo sát, thiết kế, tổng mức đầu tư, và hồ sơ năng lực của các nhà thầu.
Bên cạnh đó, CTCP Thanh Yến lập dự án đầu tư là công trình riêng lẻ trong đô thị nhưng lại không có Giấy phép quy hoạch, vi phạm khoản 2 Điều 71 Luật Quy hoạch đô thị số 30/2009/QH12 ngày 17/6/2009.
Cục Quản lý hoạt động xây dựng đã thẩm định thiết kế cơ sở của dự án nhưng lại căn cứ vào thỏa thuận phương án kiến trúc quy hoạch, trái với điểm a khoản 2 Điều 58 Luật Xây dựng số 50/2014/QH13, theo đó phải căn cứ vào quy hoạch chi tiết xây dựng hoặc tổng mặt bằng được phê duyệt.
Ngoài ra, cơ quan thẩm định không có văn bản thỏa thuận chủ trương đấu nối hạ tầng kỹ thuật đối với dự án như: giao thông, điện, nước sinh hoạt, nước thải, viễn thông… Cùng với đó, chỉ tiêu mật độ xây dựng và chiều cao công trình được chấp thuận tại Văn bản số 2097/UBND-XDNĐ ngày 14/4/2014 là 60% và vượt 01 tầng, trong khi theo Quyết định số 1396/QĐ-TTg ngày 25/9/2012 của Thủ tướng Chính phủ, giới hạn chỉ là 40% và số tầng thấp hơn.
Cục Quản lý hoạt động xây dựng không lấy ý kiến của các cơ quan, tổ chức liên quan về nội dung sử dụng đất đai trong thời kỳ quy hoạch, kế hoạch sử dụng đất được phê duyệt, vi phạm quy định tại khoản 6 Điều 10 Nghị định số 59/2015/NĐ-CP; Không thẩm định nội dung sự phù hợp của giải pháp tổ chức thực hiện dự án theo giai đoạn là thực hiện không đúng với quy định tại điểm g khoản 2 Điều 58 Luật Xây dựng số 50/2014/QH13 ngày 18/6/2014.
Mặc dù đã ban hành văn bản thẩm định thiết kế cơ sở, nhưng Cục Quản lý hoạt động xây dựng lại không kết luận rõ ràng về việc dự án Nha Trang Center 2 “đủ điều kiện” hay “chưa đủ điều kiện” để triển khai các bước tiếp theo. Điều này vi phạm quy định tại khoản 1 Điều 9 Thông tư số 18/2016/TT-BXD ngày 30/6/2016 của Bộ Xây dựng.