Ngày 4/2/2025, Cục thuế TP Hà Nội (Tổng cục Thuế) đã công bố kết luận thanh tra thuế tại Công ty cổ phần Quản lý và khai thác tòa nhà VNPT, có địa chỉ tại toà nhà VNPT, số 57 Huỳnh Thúc Kháng, phường Láng Hạ, quận Đống Đa, Hà Nội.
Kết luận thanh tra chỉ ra, công ty đã kê khai, nộp thuế vơi cơ quan thuế, tuy nhiên đơn vị còn tồn tại các nội dung.
Về thuế GTGT, công ty kê khai thuế GTGT mua vào được khấu trừ với các hóa dơn mua vào không đủ điều kiện kê khai khấu trừ. Công ty lập và nộp TKBS các kỳ (tháng 2, 5, 6, 11,12/2022 và tháng 2/2023) sau thời điểm công bố quyết định thanh tra. Tuy nhiên, kỳ kê khai tháng 2/2022 và tháng 11/2022, không dẫn đến thiếu số thuế phải nộp.
Về thuế TNDN, công ty hạch toán chi phí tính thuế TNDN với các khoản chi phí không được trừ khi tính thuế TNDN; công ty kê khai thiếu phụ lục giao dịch liên kết kèm theo quyết toán TNDN năm 2022, 2023 theo quy định. Công ty kê khai thiếu phục lục giao dịch liên kết kèm theo quyết toán TNDN năm 2022, 2023.
Về thuế TNCN, công ty không khấu trừ 10% thuế TNCN với cá nhân ký hợp đồng lao động dưới 3 tháng có tổng mức thu nhập từ 2 triệu đồng/lần trở lên theo quy định; các khoản trả lãi trái phiếu cho các cá nhân đầu tư vốn.
Về việc sử dụng hóa đơn của doanh nghiệp có rủi ro cao về hóa đơn, doanh nghiệp có thông báo bỏ địa chỉ kinh doanh. Công ty kê khai khấu trừ thuế GTGT đầu vào với 142 số hóa đơn mua hàng hóa dịch vụ của doanh nghiệp bỏ địa chỉ kinh doanh. Tổng giá trị hàng hóa dịch vụ mua vào là 1,42 tỷ đồng, thuế GTGT mua vào tương ứng là 119,1 triệu đồng.
Với những sai phạm trên, Cục thuế Hà Nội yêu cầu công ty cổ phần quản lý và khai thác tòa nhà VNPT chấn chỉnh ngay các tồn tại ở trên, điều chỉnh sổ sách kế toán và nội dung khác có liên quan đến số liệu tăng giảm để làm cơ sở hạch toán, kê khai thuế kỳ sau.
Cục Thuế Hà Nội cũng yêu cầu công ty nộp số tiền thuế truy thu, tiền phạt, tiền chậm nộp kể từ ngày nhận quyết định xử phạt vi phạm pháp luật về thuế tổng số tiền là 2,66 tỷ đồng. Trong đó, tiền truy thu là 1,73 tỷ đồng; tiền phạt khai sai mức 20% số thuế tăng thêm qua thanh tra do có hành vi kê khai sai dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp là 385,7 triệu đồng.
Số tiền phạt mà Công ty cổ phần Quản lý và khai thác tòa nhà VNPT phải nộp là 162,6 triệu đồng; tiền chậm nộp là hơn 375 triệu đồng do có hành vi chậm nộp tiền thuế. Số tiền chậm nộp thuế nêu trên tính đến hết ngày 24/1/2025.
Công ty cổ phần Quản lý và khai thác tòa nhà VNPT có trách nhiệm nộp ngay số tiền thuế truy thu, tiền phạt và tiền chậm nộp vào Ngân sách Nhà nước và tự xác định số tiền chậm nộp theo quy định của pháp luật.
Qua tìm hiểu, Công ty Quản lý và khai thác tòa nhà VNPT được cấp giấy đăng ký kinh doanh lần đầu vào năm 2009, ngành nghề kinh doanh chủ yếu là kinh doanh dịch vụ quản lý vận hành tòa nhà. Người đại diện pháp luật hiện tại là ông Nguyễn Hồng Minh. Ngoài Công ty Quản lý và khai thác tòa nhà VNPT, ông Minh còn là người đại diện pháp luật cho Viện nghiên cứu chính sách quản lý bất động sản và công trình dân dụng quốc tế.