Theo quyết định, Ban Quản lý các Khu công nghiệp tỉnh Phú Thọ (gọi tắt là Ban Quản lý) là cơ quan trực thuộc UBND tỉnh Phú Thọ, thực hiện chức năng quản lý nhà nước trực tiếp đối với các khu công nghiệp trên địa bàn tỉnh. Đồng thời, Ban Quản lý còn có nhiệm vụ cung ứng dịch vụ hành chính công và các dịch vụ hỗ trợ khác liên quan đến hoạt động đầu tư, sản xuất kinh doanh của doanh nghiệp trong các khu công nghiệp, theo đúng quy định pháp luật.
Quyết định 1481/QĐ-TTg có hiệu lực thi hành kể từ ngày ký ban hành, đồng thời bãi bỏ Quyết định số 718/QĐ-TTg ngày 07/6/2007 của Thủ tướng Chính phủ về việc thành lập Ban Quản lý các khu công nghiệp tỉnh Hòa Bình.
Để hoàn thiện cơ sở pháp lý sau khi hợp nhất, UBND tỉnh Phú Thọ được giao phối hợp với Bộ Tư pháp tiến hành rà soát, đề xuất bãi bỏ các quyết định không còn phù hợp. Cụ thể, gồm Quyết định số 971/1997/QĐ-TTg ngày 15/11/1997 về việc thành lập Ban Quản lý khu công nghiệp Phú Thọ và Quyết định số 190/1998/QĐ-TTg ngày 29/9/1998 về việc thành lập Ban Quản lý các khu công nghiệp Vĩnh Phúc.
Việc hợp nhất các Ban Quản lý khu công nghiệp của ba tỉnh nhằm tinh gọn bộ máy, nâng cao hiệu quả quản lý nhà nước và chất lượng phục vụ doanh nghiệp trong các khu công nghiệp. Đây được coi là một bước đi quan trọng trong quá trình cải cách hành chính và thúc đẩy phát triển kinh tế - công nghiệp vùng trung du và miền núi phía Bắc.