Quyết định của Cục Thuế TP. Hà Nội nêu rõ các hành vi vi phạm của Cotana, bao gồm: sử dụng hóa đơn, chứng từ không hợp pháp để kê khai thuế, qua đó làm giảm số thuế phải nộp; khai sai dẫn đến thiếu số tiền thuế phải nộp; và lập hóa đơn không đúng thời điểm, tuy nhiên hành vi này không dẫn đến việc chậm thực hiện nghĩa vụ thuế.
Với những vi phạm trên, Cotana bị phạt hành chính hơn 92,7 triệu đồng. Đáng chú ý, công ty không bị phạt riêng cho hành vi sử dụng hóa đơn không hợp pháp, vì hành vi này đã được tính vào trong xử phạt về khai sai và trốn thuế.
Bên cạnh khoản phạt hành chính, Cotana còn phải thực hiện các biện pháp khắc phục hậu quả. Cụ thể, công ty phải nộp đủ số tiền thuế giá trị gia tăng (GTGT) và thuế thu nhập doanh nghiệp (TNDN) tăng thêm sau khi cơ quan thuế kiểm tra, với tổng số tiền gần 398,7 triệu đồng. Ngoài ra, Cotana còn phải nộp hơn 46,3 triệu đồng tiền chậm nộp thuế, tính đến hết ngày 10/01/2025. Cục Thuế TP. Hà Nội cũng yêu cầu Cotana tự tính và nộp bổ sung tiền chậm nộp thuế phát sinh (nếu có) kể từ ngày 11/01/2025 cho đến khi hoàn thành nghĩa vụ nộp vào ngân sách nhà nước.
Như vậy, tổng cộng số tiền phạt, truy thu thuế và tiền chậm nộp mà Tập đoàn Cotana phải nộp là hơn 537,7 triệu đồng.
Đáng chú ý, bà Nguyễn Đỗ Hoàng Lan, thành viên Hội đồng quản trị (HĐQT) của Tập đoàn Cotana, là con gái của ông Nguyễn Đỗ Lăng, nhà sáng lập Apec Group. Ông Lăng từng giữ chức Phó Chủ tịch HĐQT Cotana từ năm 2014 đến năm 2019. Bà Lan, sinh năm 2001, được bầu vào HĐQT Cotana từ tháng 4/2019.
Theo báo cáo quản trị năm 2023, bà Nguyễn Đỗ Hoàng Lan không trực tiếp sở hữu cổ phiếu CSC. Tuy nhiên, những người có liên quan đến bà Lan, bao gồm ông Nguyễn Đỗ Lăng, bà Huỳnh Thị Mai Dung (mẹ) và ông Nguyễn Đỗ Đức Lâm (em trai), đang nắm giữ lần lượt 0,074%, gần 10,27% và hơn 0,745% vốn cổ phần tại Cotana.
Hiện tại, ông Đào Ngọc Thanh đang giữ chức Chủ tịch HĐQT Tập đoàn Cotana. Ông Thanh cũng từng là Chủ tịch HĐQT của Tổng Công ty Cổ phần Xuất nhập khẩu và Xây dựng Việt Nam (Vinaconex, mã: VCG, sàn HoSE) và đã từ nhiệm vào tháng 7/2019.
Báo cáo quản trị 6 tháng đầu năm 2019 của Vinaconex cũng cho thấy có các giao dịch phát sinh giữa Vinaconex và Tập đoàn Cotana, bao gồm giao dịch bán hàng hóa, cung cấp dịch vụ (trị giá gần 18,4 triệu đồng) và mua hàng hóa, dịch vụ (trị giá gần 9,9 tỷ đồng).